Якуши Кабуто — личный ассистент Орочимару и его правая рука. Будучи ребенком на поле боя его находит руководитель одной из медицинской команды Конохи. Он берет мальчика в Коноху, где выращивает его и обучает медицинским техникам и в возрасте десяти лет Кабуто становится Генином. Однако Кабуто присоединяется к Орочимару, когда именно это произошло пока не известно. Для Орочимару он должен четыре года принимать участие в экзамене на Чунина и собирать информацию об участниках и в особенности о Конохе. Несмотря на его очевидную преданность Орочимару его настоящую личность нельзя распознать. Он часто меняется от счастливого и вежливого подростка до сумасшедшего садиста, который наслаждается "играми" со своим противником. 

 

Позже мы узнаем, что Сасори был его бывшим хозяином и послал его шпионить за Орочимару. Однако Орочимару освобождает его от техники Сасори и до самой своей смерти наслаждается его безусловной лояльностью. 

Качества   

абуто - очень талантливый шиноби, что выясняeтся при сравнении с Хатаке Какаши. Он даже способен без особого труда убить Анбу. Большинство способностей Кабуто ограничены медицинскими техниками. Благодаря его преданности Орочимару, при помощью экспериментов со своим телом он повышает свои медицинские способности до новых уровней. С его обширными знаниями в области строения человеческого тела он способен использовать Инью Шометсу, что позволяет реактивировать мертвые клетки в концентрированном участке и создавать новые. Когда он пользуется этой способностью, он может немедленно восстанавливать себя после атак или подольше держать своего подопытного в живых. Также Кабуто может использовать Шикон но Дзюцу, что бы оживлять тела умерших на короткое время, для использования их в качестве ловушек. Медицинские способности Кабуто превосходят способности Тсунаде в его возрасте. 

Кабуто через некоторое время 

После того как Орочимару проигрывает Саске, Кабуто интегрирует оставшиеся клетки своего хозяина в своё тело, чтобы становиться сильнее, а не оставаться инструментом других. Однако клетки Орочимару пытаются перенять контроль над его телом. Этот процесс продолжается и Кабуто всё больше перенимает качества и внешность своего мастера. К тому же он дает Наруто книгу, в которой есть информации об организации Акацки и ее членах. Он делает это в надежде что Коноха уничтожит Акацки. 

 

Позже Кабуто находит Тоби, который удивлен тем, что тот смог его найти. Тоби нападает на Кабуто, после того как тот говорит, что Кабуто являлся шпионом Сасори и тем самым предателeм Акацки. Однако Кабуто использует Кучиёсе: Едо Тенсей и призывает Итачи, Сасори, Дейдару, Какузу и Нагато, что бы доказать Тоби свою силу и говорит, что не хочет сражаться. Кабуто предлагает Тоби союз, помогая ему в войне тем, что заставит призванных им Акацки сражаться ради него. Взамен на это он требует Саске для своих экспериментов. Когда Тоби намекает на то что собирается отказаться, Кабуто призывает Учиху Мадару, которого Тоби, по-видимому, боится, и соглашается на союз.

Взамен на одного из ста тысяч Зетсу, которых создал Тоби, Кабуто хочет принести ему Кьюби и Хачиби. По пути к ним на него нападает Оноки, однако змея Кабуто отыскивает остров и сигнализирует его место положения. Используя Кибаку Нендо, Дейдара обездвиживает черепаху. Прибыв на остров, Кабуто занимается Биджу и оставляет Ооноки Дейдаре по его же желанию. 

Когда Куротсучи останавливает его с помощью своего Йотона, Кабуто видит только один выход - побег. Он раскрывает свою истинную внешность: Белая змея с ногами, похожая на внешность Орочимару незадолго до его смерти. Кабуто хватает Ямато и сбегает к Тоби, который собирается поддержать его в охоте на Биджу. Позже он побеждает Митараши Анко, которая приближается к их убежищу. Tак как ее Чакра связана с Чакрой Орочимару, oн ее не убивает, что увеличивает недоверие Тоби. Кабуто говорит, что использует Анко в качестве сосуда для Эдо Тенсей, после чего Тоби требует от Кабуто, рассказать ему все подробности техники, с чем Кабуто соглашается. В то время как Тоби отправляется на поле боя, Кабуто контролирует своих призванных воинов из далека. Позже, когда Му призывает на поле боя Учиху Мадару, Кабуто разговаривает с ним через Тсучикаге. 

 

Через некоторое время, его находит Учиха Итачи, а за ним прибывает Учиха Саске. Кабуто пытается использовать ненависть Саске, чтобы тот помог ему победить Итачи, что ему не удается. Он рассказывает Итачи, что если они убьют его, то действие Эдо Тенсей не прекратится. Начинается сражение между ними. В сражении Кабуто рассказывает братьям, что он удивлен целительной силой бывшей напарницы Саске Карин, которую он получил после ее осмотра. Он также создал методику растворения, которую он разработал после наблюдения за телом Суигетсу. Кабуто также рассказывает братьям, что он побывал в одном из трех святых мест Рьючидо, где и научился входить в Режим Отшельника. Он уточняет, что больше не является белой змеей, а становится драконом, используя Сенпо: Хакугеки но Дзюцу.